Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Eb1P04230 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Eb1P04230 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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