Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms