Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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