Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms