Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms