Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt16Q9Z2K1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms