Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms