Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms