Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ilf3Q9Z1X4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms