Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms