Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms