Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx39bQ9Z1N5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms