Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog1Q9Z160 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog1Q9Z160 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms