Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms