Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup160Q9Z0W3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms