Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PoleQ9WVF7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms