Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FarsbQ9WUA2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FarsbQ9WUA2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms