Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms