Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam50bQ9WTJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam50bQ9WTJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam50bQ9WTJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms