Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PplQ9R269 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PplQ9R269 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PplQ9R269 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms