Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms