Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NrkQ9R0G8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms