Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms