Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd1Q9QY80 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms