Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Limd1Q9QXD8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms