Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dpf1Q9QX66 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dpf1Q9QX66 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms