Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms