Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms