Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms