Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg4Q9JM99 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms