Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Higd1aQ9JLR9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms