Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms