Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms