Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ybx3Q9JKB3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms