Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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