Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms