Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efcc1Q9JJF6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms