Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms