Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sv2aQ9JIS5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms