Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms