Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Brd4Q9ESU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brd4Q9ESU6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms