Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
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Rb1cc1Q9ESK9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
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Rb1cc1Q9ESK9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
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Rb1cc1Q9ESK9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rb1cc1Q9ESK9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
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Rb1cc1Q9ESK9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
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