Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
DysfQ9ESD7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DysfQ9ESD7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms