Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfip11Q9ERA6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms