Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn4aQ9ER60 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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