Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr4Q9EP82 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr4Q9EP82 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr4Q9EP82 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms