Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms