Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cbx6Q9DBY5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx6Q9DBY5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms