Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D9H8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D9H8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms