Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8N1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D8N1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms